技術服務信息
技術服務詳細描述
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應用領域
植物組織核酸提取
為了從完整種子中分離核酸,需要先用機械粉碎的方法破碎種子,再提取和純化核酸。通常的機械破碎方法是人工采用研缽和杵進行研磨的方式;但是,這種方法并不適合高通量的種子破碎,因為人工研磨速度很慢而且研缽和杵的重復使用也容易導致交叉污染。用GENO對微孔板中的種子進行機械研磨,可以同時使核酸從大量種子細胞中釋放出來;再用傳統的分離方法就可以從勻漿液中純化出核酸。用水浸泡過夜的大豆可在3分鐘內高效一致地被均質化,所得漿液可以作為DNA分析的材料來源。
從培養的細胞中快速提取基因組DNA為PCR分析做準備
在科學家的研究和診斷過程中,PCR大大提高了對核酸進行檢測和定量測序的效率。但是,因為PCR方法通常需要在模板擴增前有一個純化步驟,因此這個過程并不快。純化步驟包括細胞收集和核酸的溶解,接下來還要用層析樹脂把核酸從裂解液中分離出來。雖然這些純化方法已經很大的發展,但是它們仍然需要耗費大量時間;而且,大量重復的試驗可能會耗費大量昂貴的材料。
GENO技術能夠一次快速而低成本地破碎大量培養的細胞,從而為后期對基因組DNA進行PCR分析而做準備。用GENO對微孔板中大量的培養細胞進行高通量均質化,再通過層析樹脂對核酸進行純化,并進行PCR分析,能大大提高基因組分析的效率。
酵母的96孔高通量破碎
多年的生物化學、基因組學和分子生物學研究取得的豐富信息表明,酵母已經成為生物系統研究的模式型和生物系統研究的模式生物和生物藥學家的有力工具。酵母已成為基因表達研究和蛋白質重組表達的通用宿主,包括Picbia、Hansenula、Debaryomyces均被研究者所使用,但使用最普遍的仍然是Saccbatomyces酵母。
酵母mRNA和細胞內蛋白通常很難用傳統的酶解方法從細胞中完整地提取出來。裂解酶中通常含有核糖核酸酶和其他蛋白,它們不僅會攻擊細胞壁,而且會攻擊特定的分子。並且,由酶解產生的原生質體通常需要借助一定的試劑進行溶解而導致很多蛋白貭變性失活。因此,通常需要采用機械的方式破碎酵母細胞從而釋放其內溶物。
機械破碎酵母傳統上採用壓榨機或球磨機。這兩種方法中都是單樣品操作的。對那些需要大量酵母克隆在一個高通量篩選環境中的檢測實驗來說,單樣品操作是個瓶頸並且是不切實際的。因此,需要一種方法可以高通量的機械分裂細胞。GENO一開始為深孔版中破碎種子而設計的球磨機,現在被用來在微孔版中對酵母進行破碎。
細菌細胞的裂解(嗜鹽菌和桿菌)
GENO能通過機械碰撞的方式裂解細菌細胞。以格蘭氏陰性耐鹽菌Halomonas elongate和格蘭氏陽性桿菌為模式研究對象,SPEX已經發展了相應的兩種技術:細菌培養,收獲并沖洗掉多余的培養基,將細胞懸浮于微孔版中的鹽水溶液中,在研磨界質存在的情況下用GENO對細胞進行震蕩破碎,6-9分鐘就能夠釋放足夠量的核酸,進行后續試驗
產能達到一般方法三倍、杜邦方法兩倍數量的樣品,節省時間人力成本的耗費。
利用GENO/Grinder萃取器來增快殘留***,霜脲***(Cymoxanil), 的LC/MS/MS分析之樣品處理
* 一般方法一天八小時只能做八個樣品(需20多個步驟處理)
* 用杜邦方法一天八小時可以做十六個樣品(涉及10個步驟處理)
* 但用GENO/Grinder萃取器卻可一天八小時輕易做出三十二個樣品(只要3個步驟)
* 回收率(SPIKE RECOVERY)和其他QA/QC的效果一致
* 現已被美國環保署USEPA和食品藥物管理局USFDA采用)
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